Postdoctoral position in nuclear lipid signalling and insulin resistance in skeletal muscle in Lausanne

UNIL ist eine führende internationale Lehr- und Forschungseinrichtung mit über 5.000 Mitarbeitenden und 17.000 Studierenden auf dem Campus Dorigny, CHUV und Epalinges. Wir suchen einen Postdoktoranden, der ein Projekt leitet, das untersucht, ob definierte nukleäre Diacylglycerol (DAG) Spezies die Insulinwirkung im menschlichen Skelettmuskel ursächlich regulieren. Das Projekt kombiniert markierte, verankerte lichtempfindliche DAGs, die durch Licht an der Kernhülle primärer menschlicher Myotuben freigesetzt werden, mit zeitaufgelösten funktionalen, transkriptomischen und mitochondrialen Auswertungen. Diese zellulären Ergebnisse werden mit organellen-resolvierten DAG-Lipidomics und RNA-seq in gepaarten Skelettmuskelbiopsien integriert, die vor und nach einer Intervention in einer Studie mit Freiwilligen gesammelt wurden.

Die Position ist im Labor für Altern und Muskelstoffwechsel unter der Leitung von Prof. Francesca Amati (Institut für Biomedizinische Wissenschaften, UNIL) angesiedelt und erfordert enge Zusammenarbeit mit Partnerlaboren, die auf lichtempfindliche Lipidchemie (EPFL, Schweiz) und DAG-Lipidomics (University of Colorado Anschutz Medical Campus, USA) spezialisiert sind.

Ihre Verantwortlichkeiten:

• Der Postdoktorand wird das Projekt entwerfen, durchführen und koordinieren, von der Validierung von Werkzeugen in menschlichen Muskelzellen bis zur Integration mit menschlichen Daten.
• Einrichten von Kernhüllen-Tag-Ankern in primären menschlichen Myoblasten durch Transfektion und Validierung der Lokalisierung und lichtgesteuerten Freisetzung von passenden sn-1,2 und 1,3 lichtempfindlichen DAG-Proben mittels konfokaler Mikroskopie, DAG-Biosensoren und fraktionierten Lipidomics.
• Quantifizierung der insulinstimulierenden Glykogensynthese unter Verwendung von radioaktiv markiertem Glukose und Insulin-Signalgebung nach nukleärer DAG-Freisetzung, gefolgt von Bulk-RNA-seq und Seahorse-Respirometrie.
• Durchführung von subzellulärer Fraktionierung, gezieltem DAG-Lipidomics und Bulk-RNA-seq an gepaarten prä- und post-interventionellen Skelettmuskelbiopsien und Integration dieser Daten mit Glukose-Klemmen-, metabolischer Flexibilität- und Körperzusammensetzungsphänotypen unter Verwendung gemischter Effekte Modelle.
• Analyse von transkriptomischen und Bilddaten mit reproduzierbaren, versionskontrollierten Workflows und Anwendung von FAIR-Datenmanagementpraktiken.
• Koordination des wissenschaftlichen Austauschs mit den kooperierenden Chemie- und Lipidomics-Laboren, Mitbetreuung von Studierenden und Beitrag zur Lehre im Labor.
• Verbreitung der Ergebnisse durch Erstautor-Publikationen, internationale Konferenzen und öffentliche Engagement-Aktivitäten in Französisch und Englisch sowie Vorbereitung unabhängiger Förderanträge.

Erforderliche Qualifikationen:

• Ein Doktortitel in Biologie, Physiologie oder biomedizinischen Wissenschaften, erworben innerhalb der letzten fünf Jahre, mit einer Dissertation und starker Erfahrung in der Regulation des Skelettmusstoffwechsels durch bioaktive Lipide, vorzugsweise Sphingolipide/Ceramide oder Diacylglycerole.
• Ein dualer akademischer Hintergrund, der einen Abschluss in Biotechnologie oder Bioengineering und einen Abschluss in Sport- oder Bewegungswissenschaften kombiniert.
• Eine Erfolgsbilanz von Erstautor-Publikationen über lipidinduzierte Insulinresistenz und Skelettmusstoffwechsel, einschließlich methodologischer Publikationen.
• Praktische Erfahrung in der Kultur primärer menschlicher Skelettmuskelzellen (Myoblasten und Myotuben), Zelltransfektion und radioaktiv markierten Stoffwechselfluss-Assays (Glykogensynthese, Glukoseaufnahme und -oxidation, Fettsäureoxidation).
• Erfahrung in sowohl tier- als auch humanmedizinischer Forschung: In-vivo-Mausmodelle von Stoffwechselerkrankungen (Glukose- und Insulinverträglichkeitstests, Körperzusammensetzung, ex vivo Insulinempfindlichkeit) und Teilnahme an humanen klinischen Studien zu körperlicher Aktivität oder Inaktivität, die klinische Phänotypisierung mit ex vivo Skelettmuskelanalysen kombinieren.
• Kenntnis der Vielfalt von Lipidspezies und subzellulärer Lipidlokalisation sowie Erfahrung in der Interpretation von lipidomischen Daten im Kontext der Insulinresistenz.
• Bulk-RNA-seq-Analyse und fortgeschrittene Programmierung in R und Python, einschließlich der Entwicklung von Deep-Learning-Pipelines für die Mikroskopbildsegmentierung und quantitative Phänotypisierung von Muskelzellen, veröffentlicht als Open-Source-Code.
• Weitfeld- und konfokale Fluoreszenzmikroskopie und quantitative Bildanalyse.
• Wettbewerbsfähige Forschungsförderung als Hauptforscher, zusätzlich zu Doktoranden- oder Postdoktorandenstipendien.
• Lehrerfahrung in Bewegungsphysiologie und Zellbiologie auf BSc- und MSc-Niveau sowie Mitbetreuung von MSc- oder Ingenieurstudierenden.
• Fließend in Französisch und Englisch, mit der Fähigkeit, wissenschaftliche Texte zu schreiben und mit Laien in beiden Sprachen zu kommunizieren.

Der ideale Kandidat ist unabhängig, rigoros und gut organisiert, in der Lage, internationale Kooperationen zu koordinieren, und motiviert, eine unabhängige Forschungsrichtung zur compartment-spezifischen Lipidsignalgebung in einem kollaborativen Laborumfeld zu entwickeln.

Was die Position Ihnen bietet:

Wir bieten einen angenehmen Arbeitsplatz in einem multikulturellen, vielfältigen und dynamischen akademischen Umfeld. Möglichkeiten zur beruflichen Weiterbildung, viele Aktivitäten und andere Vorteile warten auf Sie.

Ihre Bewerbung:

Frist:

Zusätzliche Informationen: Gleichheit, Vielfalt und Inklusion innerhalb der Gemeinschaft; Gewährleistung eines offenen und respektvollen Umfelds, das die persönliche Entwicklung fördert; Bereitstellung von Arbeitsbedingungen, die eine Balance zwischen Berufs- und Privatleben erleichtern; Unterstützung von Forschern in der frühen Karriere.